近年、バイオインフォマティクスの分野で急速に注目を集めているのが、タンパク質配列をベクトル表現に変換するための大規模言語モデル "ProtTrans" です。私たちのプロジェクトでも、DeepPurpose を COVID-19 スクリーニング用に改造する際に、この...

最近、私たちが取り組んでいる話題として、DeepPurpose というオープンソースの薬剤スクリーニング AI ツールを使った研究があります。今回はこの DeepPurpose を用いて、ロングコロナに対する自然化合物のスクリーニングを行っている背景や意義についてご紹介しま...

私たちが公開している研究レポートに対して、分析手法の「妥当性」や「検証方法」に関心を寄せてくださる方が増えています。 特に、シミュレーションの結果が「単なる可視化」ではなく「物理的整合性をもつ分析」であるために、どのような確認・定量評価をしているのかが重要な問いとなります。...

本日の研究では、 「化合物X」 について、シグマ-1受容体に対する重要な知見が得られました。この化合物は、2つの既存の合成アゴニスト（ PRE-084 および SKF-10047 ）と同じ結合部位に収まることが確認され、シグマ-1受容体の活性化が期待されます。 1....

ミトコンドリアは、私たちの細胞にエネルギーを供給する「発電所」として知られていますが、その機能を維持するためには、複雑なシグナルネットワークが必要です。その中でも、 アデノシン受容体 と呼ばれる特定のタンパク質群が重要な役割を果たしており、特に A2A受容体 と A3受容体...

ロングCOVIDが急性期の重症度と相関しない理由 ロングCOVIDの症状の重さが急性期の重症度と一致しない理由は、SARS-CoV-2が感染初期に細胞に及ぼす即時の影響に起因している可能性があります。ウイルスによる初期のミトコンドリア機能障害は、急性期の症状とは独立して、長...

ロングCOVID（新型コロナウイルス感染症後遺症）において、ミトコンドリア機能不全が重要な役割を果たしていることは広く知られています。その中でも、血液中で増加する“mtDNA（ミトコンドリアDNA）漏出”に関するデータは数多く報告されています。しかし、その根本にある分子レベ...

A2AとA1受容体のバランス調整でミトコンドリアを守る 今日の研究では、特に海馬のCA3およびCA3c領域に注目し、A2A受容体とA1受容体が神経保護とエネルギー効率において果たす役割について深掘りしました。この領域は記憶やパターン認識に重要である一方、興奮性受容体が非常に...

ミトコンドリアDNA（mtDNA）の保護とエネルギー効率の改善を目指し、本日は特に注目される5つの分子を検討しました。それぞれがmtDNA機能を支える可能性を秘めていますが、現時点では研究段階やアクセス性、安全性の観点から課題が残されています。そのため、より実用的でアクセス...

今日は海馬の不調という研究をさらに掘り下げ、具体的にどの部分が問題になっているのかを研究しました。 1. 海馬の構造概観 海馬は記憶の形成や空間認知、パターン認識に関わる重要な脳領域で、大きく以下のサブフィールドに分けられます： CA1:...

長期COVIDにおける脳のエネルギー不足とその影響について、新たな洞察が得られました。以下にポイントをまとめます。 1. DMNはエネルギー効率が高いため、「感情派」モードに傾きやすい Default Mode Network (DMN)...

新しい年が始まり、いよいよ mtDNA（ミトコンドリアDNA）への介入 を研究テーマに設定しました。ミトコンドリアDNAの修復が脳の健康に与える影響を探るこの研究は、現代科学の限界を超えた挑戦ですが、それがまた楽しいですね。小さな発見を積み重ねながら、大きなブレイクスルーを...

先日のブログで、ストレスがオートファジー機能を弱め、家族の健康リスクを悪化させることについて触れました。これに関していくつか質問をいただいたため、今回は追加ブログとして、より詳しく説明していきます。 実は私も去年の12月、自宅の冷蔵庫の不調で大きなストレスを経験しました。感...

コロナウイルス長期障害の原因の一つとして、ウイルスの残留物が体内で適切に除去されず、長引く健康問題を引き起こしている可能性が指摘されています。今週後半に配信予定の新しいレポート「オートファジーとミトコンドリア回復の科学:...

新レポート「ミトコンドリア健康の進化と最適化：細胞エネルギーサポートのための先端ガイド」でミトコンドリアを取り上げた流れから、これに関するブログを投稿しています。今回はその最終盤で、ミトコンドリア不全が大きな要因になっている有名な病気を紹介し、その中で特にアルツハ...

先週「ミトコンドリア健康の進化と最適化：細胞エネルギーサポートのための先端ガイド」のレポートを配信した流れで、今回はコロナウイルスとは関係がない”一般的な”ミトコンドリア障害で現れる症状を紹介し、ミトコンドリアが不全になるとどういう状態になるのかを明らかにします。...

コロナウイルス長期障害でALS様の症状が起こり得ることは、パンデミック初期の頃からジョンズ・ホプキンス大学の報告などで明らかになっていましたが、ブレインフォグや強い倦怠感といった個々の症状と比較して広く議論されることはあまりありません。今回のブログではこのALS様症状とコロ...

はじめに 前回の「直感強化」の配信開始から約3ヶ月が経過しましたが、世界のコロナウイルス状況は変わらないどころかむしろ悪化しており、FLiRT系統と呼ばれる遺伝子変異の組み合わせを持つKP.1~3変異株がこれを牽引しています。残念ながら日本も例外ではなく、6月第一週の時点で...

今進行中の新しい分析では、「認知疲労」、つまり頭脳労働を続けて集中力やワーキングメモリが切れたときに脳はどうなっているのかというところを研究しています。 本日朝、この「頭の疲れ」の状態を説明するモデルが陽子のレベルまで突き詰められたのでブログで報告しています。...

先日、新しいレポート「直感強化」を配信開始しました。直感というタイトルですが、非言語的記憶が保存される脳部位に対する信号強度を調整するプロセスの中で、ドーパミンの感受性を高めます。そのため、ここから得られる効果が認知機能や免疫機能まで多岐にわたるので、できるだけ説明したほう...